En effet, ce programme est pour le laboratoire un moyen privilégié pour démultiplier sa capacité de recherche, assurer son renouvellement humain et intellectuel et accroître ainsi son rayonnement intellectuel et son ancrage institutionnel.

Le CSO accueille les futurs docteurs pour une durée de quatre ans, ce qui équivaut à la durée moyenne d'une bonne thèse empirique. Pendant ces quatre ans, le futur docteur qui doit disposer d'un financement pour la thèse (allocation de recherche du Ministère de la Recherche, bourse du CNRS, bourses étrangères, bourses CIFRES, financements contractuels pluriannuels) est membre à part entière du CSO, dispose d'un bureau et de toutes les facilités matérielles qu'offre un laboratoire de recherche (accès internet, bibliothèque, documentation). Ce temps passé au CSO est naturellement avant tout consacré à la préparation de la thèse. Néanmoins, pour compenser la nature souvent trop solitaire de la préparation d'une thèse et pour assurer une bonne professionnalisation des futurs docteurs, le laboratoire a cherché d'organiser des parcours d'apprentissage professionnel qui dépassent la simple préparation d'une thèse. D'une part, tous les doctorants sont tenus à suivre le séminaire doctoral qui est organisé pour les accompagner dans leur travail de thèse : d'un rythme hebdomadaire, ce séminaire auquel les chercheurs du laboratoire sont toujours conviés, permet (1) d'organiser une discussion intellectuelle autour de thèmes transversaux intéressant l'ensemble des doctorants, et (2) d'encadrer le travail de ces derniers en les obligeant à présenter à intervalles réguliers les résultats de leur travail de thèse en cours. D'autre part, les thésards sont sollicités à participer à des activités d'enseignement, de formation, de diagnostics organisationnels qui permettent de diversifier leurs compétences en vue d'une insertion professionnelle ultérieure. Enfin, le laboratoire s'intéresse activement à l'organisation de l'insertion professionnelle des doctorants, à la fois dans l'enseignement et la recherche mais aussi en resserrant les liens entre le laboratoire et des secteurs d'activité pouvant leur fournir des débouchés non académiques.

Depuis la création du programme doctoral du laboratoire au milieu des années soixante-dix, 74 doctorants y ont travaillé. Sur ces 74 doctorants, 52 ont déjà quitté le programme doctoral (14 par abandon de thèse et 38 après l'achèvement de celle-ci), et ont tous trouvé un emploi.

Depuis 1994, 19 thèses ont été achevées et soutenues. 27 doctorants poursuivent leur recherche actuellement au Laboratoire.